一个爱护弟弟的好哥哥惨死在其他妖的手里,兴邦声泪俱下的讲述让碧桃对这段感情还抱有最后的希望。她即不想与兴邦分开,又不愿对父亲有所隐瞒。所以她决定离开上海,希望兴邦能抛下复仇的想法,和她一起离开。
第二天,碧桃在火车站终于见到了兴邦。就在她以为兴邦选择了爱情的时候,兴邦一掌打在了她的后颈。兴邦选择的是复仇,没有碧桃就不可能借助捉妖学校的力量。他把碧桃藏了起来,却仍惺惺作态和其他学员一起满大街寻找。整个捉妖学校倾巢而出寻找碧桃,倾城收到永夜传来的消息后,便知时机成熟。可姚广利并非等闲之辈,女儿失踪没有让他失去理性。他在学校各处安置了陷阱,但凡有人经过就会被关进坚不可摧的囚笼内。
没过两天,就有人突袭照相馆。经过照相馆的密道,这些人杀入捉妖学校。还没等他们行凶,就触发机关被关在囚笼中。这些人来势汹汹,哪知姚教授刚开口,他们就招供是受傅兴邦指使,还提供了证据。兴邦当然不承认,可面对证据他哑口无言,这个证据就是碧桃和那对假父母。
原来从碧桃在大街上遇到兴邦的母亲开始,就是倾城设下的局。她让碧桃知道了兴邦的真面目,再从火车站一路跟踪兴邦,查到关押碧桃的地点。然后再从监狱中救出些死囚,命他们攻打捉妖学校。之后的事就水到渠成,被救出的碧桃指认兴邦,假父母也是人证。至于那几个死囚,因为他们不是妖,姚教授只能消去他们的记忆后释放。只不过倾城的计划并未到此为止,目前捉妖学校必有松懈,正是永夜行动之时。
这会姚教授正对兴邦严刑拷打,他真正的目的并不在于还有多少妖,而是龙珠的下落。而碧桃伤心欲绝,不想见兴邦受苦,希望父亲能马上杀死兴邦,长痛不如短痛。这无形之中给了姚广利很大压力,女儿和龙珠,到底应当选择哪一个。
遇到困扰的不只姚教授,还有永夜。在照相馆打杂的永夜诧异的看到段大哥把海棠领了进来,这才知道绍谦为海棠赎了身。当初永夜找海棠,只是付钱让她帮忙传递消息,从没想过要天长地久。身边突然多了这么个负担,倒也是件麻烦事。不管怎样都不能在段大哥面前露馅,所以他们还像以前一样,永夜出钱海棠将消息送到小萍手里。最新的消息就是捉妖学校增加了更多的机关埋伏,需要加以时日,永夜才能一一破解。为此,倾城不得不延缓对捉妖学校的进攻计划。
山外的世界暗流涌动,深山之中的明夏则是安逸清闲。在司空靓的调理下,明夏的感官慢慢恢复如初。司空靓对明夏的感情也越来越深,她刻意抹去倾城,只称在上海街头看到晕倒的明夏,才带回山中救治。明夏本以为这些天都是与倾城在一起,听到司空靓这么一说,心里多少有些失落。他急着想回上海,不想司空靓也要随行。明夏回到家,最开心的就是母亲方雅晴。司空靓乖巧嘴甜,又懂医术,两三下治好了方雅晴的颈椎老毛病,更得方雅晴的欢心。头一次见面,方雅晴就有意让司空靓做明家儿媳。
捉妖学校里,段绍谦正在自责。如今查出傅兴邦才是潜伏在学校中的内鬼,冤枉了明夏,以致于明夏失去感官下落不明。以此为鉴,他决定今后要无条件相信永夜,以免重蹈覆辙。却不知,永夜同样是内奸。永夜以想起小时候的游戏为借口,指挥其他同学玩捉迷藏。为了学员的安全,绍谦将校园里的机关陷阱一一说明,永夜暗暗记在了心中。
而没了兴邦的支持,在演艺圈里处处碰壁的碧桃忍不住来到关押兴邦的囚室。在内心中,她仍忘不了兴邦,想兴邦死不过是害怕自己再次被兴邦诱惑。兴邦如何看不出来,此时以退为进,自求死路才是最好的脱身之法。
碧桃狠狠将手中的锲子扎向兴邦的心脏。看着血从伤口里涌出来,碧桃伤心不已。在这样的情形下,她已经不记得兴邦曾利用她达到自己的目的,这也让她再次成为兴邦的工具。兴邦“临死”前的最后要求就是再抱下碧桃,碧桃毫无防备的解开他身上的锁链。随后的结果就是被兴邦掐住脖子,死在了她曾经爱过人的手里。
兴邦将锲子从胸口拔了出来丢在脚边,因为心脏长在右边,才让他能够用自求死路骗取了碧桃的同情。但他刚逃出囚室就碰到了永夜和绍谦,三人从地面打到楼顶。走投无路的兴邦索性摆出同归于尽的架势,冲向永夜。绍谦推开永夜,自己与兴邦一同坠下了楼。就在永夜飞速思考着是否要展开翅膀救大哥时,一张大网张开裹住了下坠的二人。兴邦再次被关押,永夜也没有暴露身份,只可惜了香消玉殒的姚碧桃。
经历了此事,永夜对绍谦的情义更加深厚,在情与义之间他不知道刚如何选择。所以当海棠通知他,倾城决定马上对捉妖学校展开行动时,他犹豫了。思来想去,永夜决定采取个折衷办法。他借口海棠知道林聪的下落,地址远在苏州。希望倾城攻打学校时,段大哥人在苏州,不受伤害。
哪知永夜聪明反被聪明误,他的一片好心,反而暴露了自己的身份。当年绍谦带人冲进张公公府时,林聪就被张公公所杀。这么多年来,绍谦一直不愿接受这个事实,所以才对外人说林聪被化成妖形的张公公劫走。现在永夜拿出所谓林聪的下落,反而说明永夜也是奸细,而且妖很快就要进攻学校。绍谦心里清楚永夜是出于好心,可他作为学校的教官,就必须以除妖为己任,不循私情。
当绍谦带领学员赶到照相馆捉拿永夜时,倾城和小萍也在赶来会合的路上。永夜知道一旦倾城出手就不可能保证段大哥的安全,他毅然现出真身,死在雨点般的飞镖之下。绍谦看着化为清水的永夜,心中也是后悔不已。不远处的倾城见来不及救出永夜,也便打消了出手的念头,悄然离开。
永夜的死激起群妖众怒。可倾城和永夜一样,对人有特殊的感情。她无比烦闷,却正好在大街上看到纠缠明夏不放的司空靓。见到恢复如初的明夏,倾城自然心情激动。可司空靓就像不认识倾城一样,死拉硬拽的把明夏拉进电影院。明夏也有很多话要对倾城说,可碍于司空靓缠着不放,只好与倾城约定明日在麦田相见。
第二天在麦田,倾城见到的不是明夏,而是司空靓。司空靓已完全撕破了脸,为了得到明夏,她可以不要倾城的内丹。可如果倾城不离开,明夏就会再次失去感官。这句话正中倾城的软肋,为了明夏的健康,她只能让步。司空靓精通医术,但不懂得爱情。她不明白爱情是双向的,阻得了倾城,却挡不住明夏对倾城的思念。
明夏没见到倾城,在大街上百无聊赖之际,抬头正看到同样心情沉重的段教官。姚教授因丧女之痛,变得有些神经过敏,总是怀疑有奸细,搞得学校人心涣散。明夏不记前嫌,愿意重回学校。只不过他是想做一名分辨者,区分妖的好坏。这一次,深有感触的绍谦认同了他的观点。
没想到姚教授反复无常,先是抓住明夏要注射失忆药后赶出学校,后又转变态度同意接收明夏。绍谦和明夏都莫名其妙,却不知这是与姚广利定有交易的兴邦在暗中指挥。倒是绍谦无意中听到吃素的姚教授最近喜吃荤,且饭量极大。他不由得心生怀疑,果然发现姚教授与藏身密室的兴邦计划利用明夏引出万妖之王聂倾城。
直到此时,段绍谦才知道姚广利建立捉妖学校的目的并非斩妖除魔,而是寻找龙珠。可他也无法活着讲出这个秘密,姚广利从背后开枪,正中绍谦的心脏。在兴邦的计划下,姚广利将绍谦的死归罪于万妖之王聂倾城,挑起明夏心中的复仇之火。
明夏咋一听倾城是害死段教官的凶手,心中一时无法接受。可姚广利根本不会考虑明夏的感受,一掌将明夏打晕,再放出风去,让倾城用龙珠交换明夏。倾城得到消息后,想都没想就同意交出龙珠。她不顾小萍的劝阻,带着龙珠来到姚广利指定的地点交换明夏。
如愿得到龙珠的姚广利哪肯留下倾城这个最大的隐患,龙珠一到手便命人围住倾城痛下杀手。既然姚广利不仁,倾城也就不义。不费吹灰之力打倒其他学员后,倾城伸出利爪冲向姚广利。却不想刚刚苏醒的明夏不分青红皂白就射出飞镖,幸亏倾城身手敏捷方才躲过一劫。明夏没看到姚广利的背信弃义,只看到化成妖身的倾城欲杀姚教授。他也不知道该如何处理自己对倾城的感情,面对倾城的质问,他只能称自己痛恨身为妖的倾城。倾城闻言大怒,也不愿再解释为何杀死众多学员。两人就在这种莫名的怨恨中大打出手,反倒让姚广利有机会逃之夭夭。以明夏的能力,根本不是倾城的对手。但倾城念及旧情下不了狠手,以至于被明夏打伤。这时久未出现的花月浓在收到小萍报信后及时赶到,从明夏手中救出了倾城。
而姚广利匆匆回到学校后,迎面就遇到了挣脱锁链逃出囚房的兴邦。兴邦以为能从姚广利手中夺到龙珠,可他万没料到姚广利早有防备。只见兴邦一接触到龙珠,全身就化为了清水。
姚广利与龙珠的渊源还要追述到宣统元年。当时大清内忧外患,摇摇欲坠。心有抱负的太妃娘娘谨记慈祥太后遗旨,命姚广利于四海内寻找被应婆婆带走的龙珠。经过数年寒暑,如今姚广利终不负所望将龙珠带回宫。
就在当年应蝶修复龙脉的所在,姚广利将龙珠放入神台。一时间地动山摇,龙脉不仅未能恢复,仅存的一些也相继崩塌将姚广利活埋在地下,连龙珠也腾空而起返回妖界。这也预示着大清气数已尽,姚广利终是机关算尽太聪明,反误了卿卿性命。
而这会龙珠已回到了花月浓手中,但这不能平复花月浓心中的担忧。她担心过于感情用事的倾城会再做傻事,于是她告诉了倾城妖的来历。所有妖的祖先是一个来自外星的人类,名叫应龙。明末时,应龙乘坐的飞船坠落在长白山一带。同行的伙伴遭到地球人的大规模袭击,纷纷化成清水变为儿童分散到地球各处,只有应龙顽强的活了下来。龙珠本是飞船中的重要部件,放入飞船方台上就能启动飞船。可飞船损坏严重,无法运转。身受重伤的应龙便在飞船内冬眠,直至来年开春。机缘巧合下,外出踏青的努尔哈赤和东哥进入飞船,救下了奄奄一息的应龙。
在东哥的悉心照顾下,应龙逐渐恢复了健康,也爱上了善良的东哥。但东哥心中只有努尔哈赤,所以他将这份感情深深藏在心里。可落花有意,流水无情,努尔哈赤只想着征战扩疆,全无儿女私情之念。
东哥的一片痴情换来的终是一颗苦果。努尔哈赤选择入赘塔本巴晏家,娶大福晋佟佳。东哥心生怨恨,赌气之下嫁给了应龙。这对命运造就的怨偶没能维持太长时间,东哥抑郁而终。临终前,仍未忘怀的东哥请求应龙照顾努尔哈赤。于是应龙利用飞船内的外星科技,帮助努尔哈赤开疆扩土建立后金,成为大清入主中原前的第一位皇帝。
多年后,应龙说起东哥,努尔哈赤方才吐露心声。他内心一直爱恋东哥,但也正是因为爱,才不愿让东哥过担惊受怕的日子。所以努尔哈赤娶了佟佳,就是想让东哥嫁给应龙,过幸福平静的生活。可事与愿违,东哥红颜薄命让人惋惜。
如今天下已定,努尔哈赤反而对能力超凡的应龙放心不下。他命人将初遇应龙时的山洞搬到了盛京,更欲将已打算功成身退的应龙除之而后快。以应龙的能力并不惧努尔哈赤的威胁,可他为了遵守东哥的遗愿,并没有伤害努尔哈赤,还承诺此后子子孙孙都将守护着爱新觉罗家族。因此飞船留在了努尔哈赤手中,被称之为龙脉。之后龙脉被孝庄太后从盛京搬到了北京,埋在了紫禁城的金水湖下。应龙的后人也就成了爱新觉罗家的守护人,直到应蝶的母亲应婆婆。
在听了花月浓讲述的往事后,倾城才知道龙珠只是开启飞船的锁匙,像姚广利这种不懂得其中奥秘的人,自然会出事。所谓的“得龙珠者得天下”,也只是以讹传讹的误会而已。而花月浓已经与外星球的同胞取得了联系,将会有另一艘飞船前来。愿意回到母星的妖,都可以乘船回家。花月浓希望倾城放下与明夏的感情,返回母星,不再涉足人类之间的是是非非。
心中惆怅的倾城不知不觉的来到明夏家的院外,回想着与明夏的点点滴滴。突然她看到明夏抱着一动不动的司空靓上了车,方雅睛也跟着上车,向医院方向开去。在医院里,医生对司空靓的病也是束手无策,他们从没见过这样的病情,明明心脉已断人却仍然活着。司空靓苏醒后看到明夏焦急的眼神,心中倍感欣慰。她自知时日无多,想在最后的生命里披上洁白的婚纱,体验一次幸福的感觉。病床边的明夏只能答应准备婚礼,躲在病房外的倾城此刻心如刀绞,可这也未尝不是一个好的结局。
第二天,穿着婚纱等待着仪式开始的司空靓遇到了不请自来的倾城。倾城成全了司空靓的心愿,失去内丹的她将留在地球长时间的冬眠,或许会因此失去性命。司空靓没想到倾城会因为爱明夏而成全她,这是种无私的爱。相比之下自己处处想着占有明夏,这样的感情显得如此狭隘。终于她怀着歉疚,在婚礼的礼台上向明夏说出了真相。
明夏体会到了倾城对自己的深情。从母亲的反应里,他也明白了一直出现在他脑海里的女人就是倾城。明夏不顾一切的冲出教堂,想找到倾城。可他没有看到前方疾驰而来的汽车,被车撞飞的那一瞬间,他想起了所有的事,随后重重落下,倒在血泊之中。
在经过抢救后,明夏恢复了健康。他带着曾经的记忆踏遍千山万水寻找倾城二十年,直到在深山中偶遇花月浓。明夏的执着感动了花月浓,指点他来到倾城冬眠的深潭。明夏看到从深潭中破冰而出的倾城,激动之余他却不知道自己能否接受背后生有双翅的倾城。这也许就是人类的宿命,人妖殊途,爱得越深痛得越深。应龙与东哥如此,明夏与倾城亦如此。