江湖游医吴又可，被大将军孙传庭（戴立忍饰）委以重任，共同联手抵抗瘟疫。经过他的研究发现，瘟疫病毒并非是入侵肌肤而感，而是通过口鼻呼吸传染，因此他根据不同程度的病情进行隔离治疗，对症下药。但是面对瘟疫，任何人都会忐忑，也会害怕死亡，但是吴又可实际上更希望去更多的救治病患。

一代良将，胸怀济世之才却苦于无赏识之人。当终于临危受命之时，却大势已去，回天无力。孙传庭一腔报国之情却得不到朝庭的信任，被迫在准备不足的情况下与数倍于已的敌人决战，最后为国捐躯，悲壮一生。

孙夫人，隐忍、坚强，在孙传庭入狱期间，独自撑起整个家庭，抚养幼子，当崇祯皇帝二度启用孙传庭，令其出军抵抗闯军时，孙夫人携幼子伴其左右毫无怨言。