疑犯追踪第五季

第1集

上一季，在撒玛利亚的步步紧逼之下，芬奇还是成功地把机器的代码，压缩至一台装有一大堆内存的手提箱里，解救了出来。

新的一季，撒玛利亚继续对芬奇一行人进行追杀。芬奇和里瑟带着手提箱登上了前往曼哈顿的渡轮，并来到了地铁站的秘密基地。芬奇试图解压缩位于手提箱中的机器，但失败了。

根逃到了俄罗斯黑客贝拉的地盘，但被贝拉出卖，撒玛利亚的人员找到了根。正在这时，里瑟赶到，救走了根，并带她来到了秘密基地。根还从贝拉的仓库里，带走了300台最新款的游戏机。他们用这些游戏机建造了一台超级计算机，来解压缩机器。但由于散热问题，超级计算机差点烧坏，里瑟从地面上搞到一瓶液氮，化解了这一危机。机器的解压缩能否成功呢？

弗斯科被FBI调查，但最终不知为何，又被无罪释放了。芬奇也不断回忆起创造机器时，发生的一些事情。

第2集

机器启动了，但脸部识别功能异常，而且之前建造的超级计算机运算能力也不足。里瑟和芬奇前去抢劫，得到了所需的计算机。机器恢复了正常，并且一次提供了30个号码。 

根据机器提供的线索，里瑟追踪到了一个孩子，机器显示他试图炸毁一所学校，但实际上他只是为了逃学，向学校谎称今天有恐怖袭击。其他几个疑犯也都没有真正的犯罪倾向。机器似乎仍有问题。

里瑟和福斯科对剩下的27个号码进行了筛选，锁定了两个人员。其中一位是一名游客，正巧这名游客来到警局，里瑟接待了她。但她开始攻击里瑟。

机器将芬奇和根视为了威胁，并向根的耳蜗植入器发送了过大功率的信号，以示警告。根不想成为谈判的筹码，于是选择用麻药昏迷过去。芬奇发现是机器派了那名游客攻击里瑟，经过努力，芬奇终于说服了机器，机器恢复了正常。

第3集

故事从2010年开始，还在中情局工作的里瑟和凯瑞接到上司任务，调查一个涉嫌卖情报给塔利班的士兵。在这个士兵的房间里，里瑟和凯瑞没有发现任何证据，但按照上司指示，里瑟还是开枪杀死了这个士兵。

机器给出了新的号码，里瑟前去调查，这次的疑犯叫艾里克斯·邓肯，在一家国际咨询公司的安全部门工作。邓肯被中情局带走，而为首的正是里瑟的前上司比勒。里瑟冒险救出了邓肯，发现邓肯正是之前被自己枪杀的那个士兵的弟弟。

比勒再次抓到了里瑟和邓肯，但里瑟成功逃脱，并和比勒达成默契，放弃追捕邓肯。

根被机器派到了一个快递公司，原来是运输的货物中有一批电子产品，而这些产品都被装上了恶意软件。芬奇发现，这些恶意软件会搜集用户信息，并传给撒玛利亚。

第4集

肖终于出现，原来她被撒玛利亚的人员绑架，为了控制肖，他们给她的大脑里植入了芯片。但肖利用看守的疏忽，逃脱出来。肖怀疑自己正被人跟踪，没有立即去找队友，而是来到一家超市，拿到所需器材，试图自己把芯片取出，但没能成功。为了给芬奇他们发送暗号，肖伪造了一起谋杀案。撒玛利亚的人员也来到现场，但根及时赶到，救出了肖。里瑟和根给肖做了手术，取出了芯片。

芬奇担心肖已经被策反，肖责怪芬奇没有尽力寻找自己。肖和根重归于好，啪啪啪。芬奇分析了取出的芯片，发现那只是安慰剂。肖发现自己被队友们怀疑，非常生气，决定现在就向撒玛利亚宣战，以表明自己的立场。肖故意向撒玛利亚暴露行踪，引来了撒玛利亚的人员。在里瑟和根的协助下，肖击倒了他们，并追踪到了撒玛利亚的老窝，带走了格瑞尔。芬奇把他们叫到了一个教堂。

肖从格瑞尔的手臂里发现了一个U盘，芬奇试图破译这个重重加密的U盘。这时，肖开始神志不清，她杀死了格瑞尔，并击伤了里瑟。最后，面对根，肖选择了自杀。 

而到了最后的最后，我们才发现，以上情节都是格瑞尔在肖的头脑里进行的模拟实验。通过这些实验，格瑞尔试图操控肖的想法和行为。