烟波岛上,发生了渔民失踪事件。晚上值班的渔民老林遇到了黑色黏液,从渔船消失。伴随老林的消失,一名神秘女孩进入了小镇。第二天,岛上的学生付君浩、张宇轩和游尚杰,偶遇了在地上挣扎的女孩,付君浩关心女孩,女孩却跑开了。
付君浩三人追着女孩来到枯井边,女孩不见踪影,却发现井里有怪声。随后目睹了一条沾满黑色粘液的鱼从井中蹦出。地理课上,沙拉正在讲关于环境保护的内容,付君浩提出一起去渔船。
晚上,付君浩等三人来到渔船,三人发现了神秘女孩躲在船上。付君浩出于好心,将女孩带回家中,只得将女孩收留在家中,女孩一个人在房间的时候,突然表情变得很奇异。此时,游尚杰在独自回家途中,遭遇“黑色黏液”袭击,消失的无影无踪。
渔船上出现了一伙神秘人,称有变异生物并报告发现了博士的衣服碎片,杜先生变得严肃。夜晚,留宿付君浩家的女孩噩梦惊醒。付君浩将自己的随身听给女孩,安慰女孩睡下。
翌日,付、张二人来到学校,被告知游尚杰失踪。码头上,居民沙建质问老林的下落,和渔船公司老板的儿子苏民绪发生冲突。沙建离开,而暗中已有神秘人盯上了沙建。
此时,杜先生在一个铁门前,手下在洞中发现了“试剂样本。” 付、张两人放学来到游尚杰家询问,碰到游尚杰离异父母争吵。两人离开,来到游尚杰失踪地点探查,付君浩的球鞋踩到了黑色粘液。
此时,留在付君浩家中的女孩,整理了房间。付君浩奶奶回家,听到声音,上楼查看。二楼女孩表情变得奇异,付奶奶似乎有危险。
杜先生的手下将试剂送出。付、张二人回家,发现空无一人。奶奶买了吃的给女孩,以为是付君浩惹事。付君浩解释后,再次寻找阿杰,结果被女孩看到鞋上黏液对其很感兴趣。
沙建在外,遇到妹妹沙拉被问是否打架。沙建否认离开。随后,遭到神秘人的埋伏。翌日,付、张二人带女孩来到踩黏液处,女孩发现元件,开始找阿杰。
沙建醒来认为被苏民绪暗算,找其报复,两人打架时,沙拉阻止了冲突。苏民绪回去后气愤不已,说要报复,被父亲苏万三阻止。沙拉家,二人争执,沙拉希望哥哥别惹事,沙建认为自己伸张正义。
二人和好后,沙建离开。晚上,三人寻找无果,张宇轩看到女孩的奇异表情。沙建路过了枯井,当他上前查看,井口冒出“黑色黏液”,沙建消失。
付、张二人商量去学校实验室,研究黏液。女孩也提出同去。杜先生来到基地,科研人员陈博士,说之前带出来的试剂有问题。杜先生对着墙上女孩的照片恼怒,指派手下在小镇寻找。
翌日,付君浩给女孩取名“林小舟”,带女孩去学校。在学校,遇到张宇轩反对女孩参与。此时三人遇到了请假去找哥哥的沙老师,差点露馅而后被付君浩搪塞过去了。
阿杰父亲游大海,因为把阿杰骂出了家,十分自责。在查看阿杰书桌时发现了日记,日记中提到以前的幸福时光,日记里提到会去海边,游大海赶往海边寻找。
在学校实验室里,付、张二人看不出黑色黏液,但小舟对这些器物十分熟悉,开始娴熟的操作,画出了黑色黏液的细胞图。看着细胞图,她想起了什么,突然一阵头疼。