《终极一班3》是继《终极一班》、《终极一家》、《终极三国》、《终极一班2》后的第五部终极系列青春偶像剧，故事延续了《终极一班2》的结尾中被改变的金时空未来，一切从战力指数和KO榜都回归了开始，金时空出现了奇怪的情况，许多人战力指数以异常的趋势飙升着，让KO榜出现了剧烈的变动，因此导致多方人马争斗不休，影响了已停战十年平静安详的金时代。

原本是维护时空秩序的异能行者汪大东（汪东城饰）因为在执行任务中捅了篓子而被盟主派遣到与怪异现象有很大关系的芭乐高中去，让他重返终极一班就读，边将功赎罪边调查真相。而此时的芭乐高中门口正上演着一场混战，大东突然的出现被芭乐高中现任的终极老大雷婷（曾沛慈饰）一个攻势而甩飞好远，可待终极一班的人看清楚才知道这不就是他们朝思暮念的创始元老东哥嘛？！

不认识大东的雷婷似乎从此与他结下了梁子......

而重返终极一班的大东是否能查出这一切的真相呢？......